教育部今天在金門舉辦「100年度第2次全國教育局處長會議」，吳清基與各縣市教育局處長與會。
總統馬英九在今年元旦文告中宣布，從今年開始啟動十二年國民基本教育，分階段逐步實施，先從高職做起。預定103年起高中職學生全面免學費、大部分免試入學。
教育部統計，97學年度至110學年度國中畢業生將從每年31萬7975人降至19萬9700人。101學年度預估國中畢業生跌破30萬人，為28萬 5552人；110學年度預估國中畢業生跌破20萬人，為19萬9700人。由於少子化的影響，教育部希望推動免試入學。
教育部草案規劃，免試入學不採計國中在校成績，各高中、高職和五專不訂定入學登記門檻或條件。
草案研擬，當參加免試入學學生，登記人數未超過學校招生名額，則全額錄取；如果登記人數超過核定名額，學校可以用超額比序條件，必要時得採抽籤方式，但是學校要在1年前公告。
台灣劃分出15個免試就學區，其中桃園縣和連江縣是在同一區域。連江縣教育局長邱金寶在會議中提出，希望能和基北區畫在一起。
吳清基說，如果連江縣和基北區同一區，擔心馬祖高中的學生會流失，原則上維持既有的15個免試就學區規劃。