Mclaren F1的動力系統可說是直接流用賽車引擎，代號S70/2的BMWV12引擎，乃是由原本的5.6升S70引擎改良而來，採用60度小夾角設計，結構較為緊湊，寬度與長度都比一般的V12引擎更小，並採用全鋁合金本體與上座，搭配乾式油底殼，重量輕盈且重心更低，完全針對競技而設計。
引擎的缸徑與衝程分別為86mm與87mm，並非專注於高轉速的短衝程設計，而是強調均衡性，具備可變汽門正時機構，以及賽車等級垂直12喉直噴進氣系統，即每個進氣歧管都有一個節氣門控制空氣流量，搭配大型碳纖維集氣箱與雙流量感知器，提供高轉速所需，至於壓縮比則是提升至10.5：1的境界，在當時算是相當優異的水準。
市售版S70/2引擎可於7500rpm輸出627hp最大馬力，並於4000rpm輸出62.9kgm最大扭力，雖然是高轉速引擎，但中低轉速扭力依然強勁，對於一輛不到1.2公噸的超輕量化超級跑車而言相當受用。
為了縮短動力系統的體積與長度，Mclaren F1雖然是中置引擎+後輪驅動設計，卻採用獨特的橫置六速手排變速箱，並非一般超級跑車慣用的縱置變速箱，然而Mclaren F1的設計有效縮減重量與體積，且後懸吊系統直接固定在變速箱上，與目前F1賽車的設計相似，節省後懸吊副支架的體積與重量，雖然是20年前的跑車，設計理念卻相當先進。