「藤原效應」源於日本藤原（Fujiwhara）博士於1921至23年一系列的渦旋實驗及觀測。他發現兩個距離很近的氣旋性渦旋會受到對方的影響，互相沿著兩者中心所形成的軸線心，呈氣旋性方向移動。兩個渦旋並有彼此接近及合併的趨勢。
在氣象學上，「藤原效應」應用於雙熱帶氣旋的相互作用上。一般來說，兩個熱帶氣旋相距約12緯距（約1350公里）時便可能產生相互影響。當這效應出現時，兩熱帶氣旋會沿著軸心依逆時針方向（在北半球）相互旋轉（圖一）。軸心並非一定在軸線的中間位置，較強的熱帶氣旋會支配著較弱的熱帶氣旋的路徑。
雙熱帶氣旋的相互作用會因受外圍大尺度天氣系統更強的影響、其中一方減弱或被合併而結束。天文台的研究顯示若雙熱帶氣旋維持在1200公里以上的距離，其合併的機會不大。 
圖一：熱帶氣旋的相互作用
「藤原效應」一個例子是2006年8月熱帶氣旋悟空和清松的相互影響（圖二及三）。從圖中可見悟空受到清松的影響，於14及15日有明顯的逆時針方向移動路徑。 
圖二：2006年8月熱帶氣旋悟空和清松的路徑。
圖上顯示的時間為協調世界時間。 
圖三：悟空繞著清松相對作逆時針轉動
每年夏季，西北太平洋均會有熱帶氣旋出現，而兩個熱帶氣旋同時出現的情況並非罕見。當「藤原效應」發生時，熱帶氣旋往往會改變移動方向及速度，令預測其移動路徑難度增加。